公司扣工资需视情况而定。根据《劳动合同法》，劳动者有权辞职，若公司无故扣工资，可能违反法律规定。不及时处理可能导致权益受损，无法追回应得工资。
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辞职被扣工资可这样处理：1.与公司协商，说明辞职原因，争取不扣工资；2.若协商无果，向劳动监察部门投诉，要求介入调查；3.仍无法解决，申请劳动仲裁，提交相关证据，维护自身权益。
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处理方式有协商、投诉、仲裁等。应先与公司协商，协商无果可向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁。选择时需考虑效率与成本，仲裁为最终法律途径。